Matthew wurde am 9. März 1980 in Las Vegas geboren. Er machte seinen Abschluss an der Las Vegas Academy of International Studies. Sein Hauptfach dort war Schauspiel. An der New York University’s Tisch School of the Arts belegte er die Kunst des Filmemachens, etwas, das ihn schon immer interessierte. Gubler besuchte auch die University of California. Während seiner Zeit an der NYU arbeitete er als Model für Marken wie Tommy Hilfiger, Marc Jacobs und American Eagle.
Gubler debütierte als Regisseur 2004 mit The Life Aquatic with Steve Zissou. Im Jahr 2006 kam er dann mit einer brillanten und einzigartigen Idee von Mockumentaries, in denen er sich über die Hollywood-Kultur lustig machte – er nannte sie “Matthew Gray Gubler: The Unauthorized Documentary”.
Gubler führte Regie, schnitt und koproduzierte das Musikvideo der Band The Killers, Don’t Shoot Me Santa. Zu seiner Filmografie gehören Filme wie RV (2006), Alvin und die Chipmunks (2007), The Great Buck Howard (2008), How to Be a Serial Killer (2008), (500) Days Of Summer (2009) und Excision (2012).