Während seines Studiums in Rollins lernte er Sara Joanne Byrd kennen, die er am 9. Juni 1952 heiratete. Sie bekamen zwei Söhne namens James und John. Er schloss 1963 sein Studium am Theologischen Seminar in Pittsburgh ab und wurde zum Pfarrer der Presbyterianischen Kirche geweiht.
Rogers wurde berühmt, weil er die beliebte Kindersendung Mister Roger’s Neighborhood ins Leben rief und moderierte, in der er seine sanfte, ruhige Persönlichkeit, seine Direktheit gegenüber dem Publikum und seine Strickjacken präsentierte. Im Jahr 1967 wurde die Sendung in Pittsburgh ausgestrahlt und im darauf folgenden Jahr von CBS übernommen. Sie wurde zu einem festen Bestandteil der öffentlichen Fernsehsender in den USA. Die Sendung wurde 2001 eingestellt, aber Wiederholungen werden weiterhin in vielen PBS-Sendern ausgestrahlt.
Aufgrund seines Unmuts über die Art und Weise, wie das Fernsehen Kinder anspricht, bemühte er sich, dies zu ändern. Er begann, für lokale Sendungen in Pittsburgh, die sich an die Jugend richteten, zu schreiben und dort aufzutreten. 1968 entwickelte WQED seine eigene Sendung, die landesweit vom Eastern Educational Television Network ausgestrahlt wurde.
Fred Rogers wurde zu einer unauslöschlichen amerikanischen Ikone der Kinderunterhaltung und -erziehung sowie zu einem Symbol für Mitgefühl, Geduld und Moral. Er erhielt die Freiheitsmedaille des Präsidenten, rund vierzig Ehrentitel und einen Peabody Award. Er wurde in die Television Hall of Fame aufgenommen. Er wurde durch zwei Resolutionen des Kongresses gewürdigt. Der TV Guide wählte ihn auf Platz 35 der fünfzig größten Fernsehstars aller Zeiten. Verschiedene Gebäude und Kunstwerke in Pennsylvania sind seinem Andenken gewidmet. Die Smithsonian Institution stellt einen seiner Markenpullover als Schatz der amerikanischen Geschichte aus. Am 27. Februar 2003 starb er an Magenkrebs.